MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TTA	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017491	GAG	2	6	150	155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017491	CTATTA	2	12	1626	1637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017491	TATAT	2	10	1650	1659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017491	AT	4	8	1656	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017491	ACG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017491	AGG	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017491	A	6	6	2858	2863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017491	T	6	6	2893	2898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017491	TCC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017491	GCAA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017491	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017491	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017491	TTTA	2	8	3208	3215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017491	TAAAA	2	10	3254	3263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017491	GAT	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017491	T	6	6	3339	3344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017491	TAGGC	2	10	3465	3474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017491	G	6	6	3534	3539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017491	T	6	6	3591	3596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017491	TAAT	2	8	3613	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017491	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017491	GAG	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017491	GAG	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017491	CAT	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017491	AAAT	2	8	10029	10036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017491	T	6	6	10054	10059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017491	AAC	2	6	10113	10118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017491	GTT	2	6	10140	10145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017491	AAAAT	2	10	10187	10196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017491	T	6	6	10222	10227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017491	TTA	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017491	TAT	2	6	10272	10277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017491	T	7	7	10283	10289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017491	GAAA	2	8	10291	10298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017491	TTA	2	6	10314	10319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017491	A	6	6	10356	10361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017491	GTA	2	6	10612	10617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017491	T	6	6	10660	10665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017491	AGA	2	6	10666	10671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017491	A	6	6	10678	10683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017491	A	7	7	10708	10714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017491	AAT	2	6	10746	10751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017491	CTT	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017491	GGT	2	6	11226	11231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017491	ATT	2	6	11283	11288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017491	AGT	2	6	11974	11979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017491	TTA	2	6	12039	12044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017491	AGG	2	6	12084	12089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017491	AGG	2	6	13094	13099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017491	T	8	8	13389	13396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017491	AT	3	6	14163	14168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017491	AT	3	6	14309	14314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017491	TA	3	6	14363	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017491	ATTTG	2	10	14372	14381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017491	AGG	2	6	14402	14407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017491	ATA	2	6	16950	16955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017491	AGG	2	6	16970	16975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017491	A	6	6	17202	17207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017491	CTAA	2	8	17213	17220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017491	CA	3	6	17243	17248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017491	GTA	2	6	17698	17703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017491	TGA	2	6	17716	17721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017491	ATT	2	6	17731	17736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017491	TTTA	2	8	17828	17835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017491	ACG	2	6	17899	17904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017491	ATT	2	6	18235	18240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017491	ATA	2	6	18241	18246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017491	AAG	2	6	18300	18305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017491	A	7	7	18371	18377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017491	T	7	7	18443	18449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017491	ATTT	2	8	18468	18475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017491	T	6	6	18489	18494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017491	ATAC	2	8	19257	19264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017491	AGTG	2	8	19359	19366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017491	A	7	7	19377	19383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017491	ATTC	2	8	19390	19397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017491	CAG	2	6	19430	19435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017491	TTTC	2	8	21207	21214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017491	T	6	6	21249	21254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017491	TCT	2	6	21359	21364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017491	AAT	2	6	21366	21371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017491	TCA	2	6	21379	21384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017491	AT	3	6	21403	21408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017491	GGC	2	6	21429	21434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017491	AAT	3	9	21459	21467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017491	AAC	2	6	21486	21491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017491	CTG	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017491	GGGC	2	8	21553	21560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017491	CAA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017491	TGCG	2	8	21595	21602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017491	TCC	2	6	21616	21621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017491	ATG	2	6	21639	21644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017491	CAA	2	6	21647	21652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017491	TTG	2	6	21772	21777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017491	AC	3	6	21790	21795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017491	TTTG	2	8	21816	21823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017491	GGC	2	6	21860	21865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017491	AGG	2	6	24132	24137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017491	A	6	6	24208	24213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017491	GTT	2	6	24243	24248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017491	TTAT	2	8	24256	24263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017491	GGGT	2	8	24320	24327	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017491	TTAA	3	12	25598	25609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017491	CCT	2	6	29076	29081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017491	GTT	2	6	29130	29135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017491	TAA	2	6	29140	29145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017491	TGT	2	6	29194	29199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017491	GCC	2	6	29801	29806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017491	ATG	2	6	31031	31036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017491	CGC	2	6	31081	31086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017491	GCG	2	6	31107	31112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017491	TTGC	2	8	31116	31123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017491	TGC	2	6	31928	31933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017491	TCA	2	6	32030	32035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017491	AAG	2	6	32076	32081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017491	ACG	2	6	32695	32700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017491	AT	3	6	32712	32717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017491	TGA	2	6	32750	32755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017491	ATC	2	6	32769	32774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017491	T	6	6	32785	32790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017491	CAAA	2	8	32879	32886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017491	TAAAGG	2	12	32925	32936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017491	CAA	2	6	33955	33960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017491	GAT	2	6	33963	33968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017491	GTAT	2	8	33973	33980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017491	AG	3	6	34001	34006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017491	T	6	6	34053	34058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017491	A	6	6	34096	34101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017491	AC	3	6	35624	35629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017491	TCA	2	6	35667	35672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017491	AGAA	2	8	35718	35725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017491	TCT	2	6	35728	35733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017491	GATTT	2	10	36480	36489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017491	TTG	2	6	36560	36565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017491	CAG	2	6	36598	36603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017491	GTTT	2	8	36618	36625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017491	AAG	2	6	36656	36661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017491	TA	3	6	36683	36688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017491	TTAAT	2	10	36695	36704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017491	AAT	2	6	36810	36815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017491	TGT	2	6	37415	37420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017491	AAGT	2	8	37426	37433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017491	CCGG	2	8	37460	37467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017491	GTT	2	6	37520	37525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017491	TCG	2	6	37526	37531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017491	AG	4	8	37646	37653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017491	TGA	2	6	37661	37666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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